Card 1
Question
Wo spielt die Homologe Rekombination eine wichtige Rolle?
Answer
Meiose, DNA-Reperatur (Doppelstrangbruch), bei Blockierten Replikationsgabeln
Biochemie 2
Würzburg Uni
- Subject
- Sciences / Chemistry
- Language of creation
- German
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Cards in this set
Card 2
Question
Nenne drei Enzyme, die essentiell für die Homologe Rekombination sind.
Answer
RecA: erzeugt aggressive Einzelstränge
RuvAB: katalysiert holliday junction und branch migration
RuvABC: Resolvosom -> Exonuclease aktivität, löst Holliday Junction
Card 3
Question
Was sind die Endprodukte die nach Branche Migration entstehen und was sind die Konsequenzen für genetische Vielfalt?
Answer
Je nachdem, ob RuvC die sich ursprünglich kreuzenden oder nicht kreuzenden Stränge schneidet entsteht:
Heteroduplex: keine änderung des Gen. Materials
Rekombinante DNA: geänderte Zusammenstellung des Gens
Card 4
Question
Was sind die 4 Phasen der Transkription?
Answer
1) Template-Erkennung
2) Initiation der Transkription
3) Elongation
4) Initiation der Termination
Card 5
Question
Unterschiede der Transkription in E. Coli und in Eukaryoten (RNA-Pol 1)
Answer
Eukaryoten: getrennte Translation und Transkription
E. Coli: kotranskriptionelle Translation
Card 6
Question
Aufbau der Nukleosomen anhend einer skizze
Answer
Es muss vorhanden sein:
- (H2A, H2B, H3 und H4) X2
- Histon-Tails
- DNA
Card 7
Question
Welche Bedeutung hat die Histon-Acetyltransferase (HATs) für die Aktivierung der Transkription?
Answer
Sie acetylieren die Histon-Tails, wodurch es zur Lockerung der Nukleosomenstruktur kommt.
Dadurch können transkriptionelle Aktivautoren und Chromatin Umformungskomplexe an die DNA lagern.
-> RNA-Pol kann effizient transkribieren
Card 8
Question
Wie wird das 3'-Ende einer eukaryotischen mRNA modifiziert und was sind die Funktionen?
Answer
Polyadenylierung, Schutz des 3'-Endes und Initiation der Translation
Card 9
Question
Wie wird das 5'-Ende modifiziert, was ist der zugehörige Co-Faktor und wie wird dieser generiert?
Answer
Das 5'-Ende bekommt ein Cap -> Capping
Struktur: 7-Methylguanin, PPP, Guanin
Kofaktor: SAM
-> Methionin und ATP gebildet
Card 10
Question
Welche Sequenzen kennzeichnen im primären Transkript nicht-codierende Bereiche?
Answer
5'-SS
3'-SS
BP
Pp-Tract
Card 11
Question
Was sind die wichtigsten trans Faktoren, um Introns zu entfernen und welche Funktion haben sie?
Answer
U1, U2, U4/6 und U5
U1: definiert 3'-SS
U2: definiert BP
U2/6: Katalytischen Zentrum
U5: 5'-SS
Card 12
Question
Wie kann das Herausschneiden einer nicht-codierende Sequenz verhindert werden?
Answer
Extrinsic Splicing Silencer (ESS)
Durch eine Oligonukleotid Kette wird die 3'-SS und/ oder der BP blockiert und das Spleißosom kann sich nicht mehr ablagern.
Card 13
Question
Welche Rkt. Schritte sind für die Bildung von Aminoacyl-tRNA notwendig?
Answer
Aminoacyladenylat + RNA -> Aminoacyl-tRNA
Durch Aminoacyl-tRNA-Synthetase katalysiert
Card 14
Question
Wie ändert sich die Rkt-v. Bei der Peptidyltransferase-Rkt., wenn der pH-Wert steigt?
Answer
Die Aminogruppe wird nukleophiler, wodurch die Reaktionsgeschwindigkeit steigt.
Card 15
Question
Mechanismus der RecA/Rad51-vermittelten Strandaustausches.
Answer
RecA bindet ATP und polymerisiert auf Einzelstran -> aggressiver Einzelstränge wird gebildet
Sucht dann dsDNA nach homologer Region ab -> entwindet dabei DNA und bildet dreisträngiges Intermediate
Nach ATP-Hydrolyse kommt es zur verdrängung des sequenzgelichen Strangers aus der dsDNA
Card 16
Question
Was sind die Reaktionsschritte für die Aktivierung der Aminosäuren ?
Answer
AS + ATP -> Aminoacyl-AMP + PPi
Aminoacyl-AMP + tRNA -> Aminoacyl-tRNA + AMP
Als Katalysator: Aminoacyl-tRNA-Synthetase
Card 17
Question
Aufrechterhaltung der zellulären Eisen-Homöostase im Bezug auf die Ferritin- und Transferrinrezeptor-mRNAs.
Answer
Ferritin = Speicher
-> IRE im 5'-UTR:
--> Fe hoch: Translation aktiv
--> Fe niedrig: Translation blockiert
Transferrin = Transporter
-> IRE I'm 3'-UTR
--> Fe hoch: Translation blockiert
--> Fe niedrig: Translation aktiv (mRNA-Stab. Erhöht)
Card 18
Question
Warum ist die spontane Desaminierung der DNA-Base Cytosin in lebenden Zellen ein mutagenes Ereignis?
Answer
Da durch die Desaminierung wird Cytosin zu Uracil und es wird kein Guanin mehr, sonder ein Adenosin gepaart.
Card 19
Question
Durch welchen Reperaturmechanismus wird die Cytosin-Desaminierung repariert?
Answer
Durch Uracil-DNA-Glycosylase wird die Mutation erkannt und auf der AP-site durch Endonuklease ausgeschnitten.
Die Lücken werden dann durch Ligas und RNA Pol. 1 wieder gefüllt.
Card 20
Question
Mechanismus von Typ 2 Restriktionsendonukleasen + Grundlage der Sequenzspezifität
Answer
1)Symmetrisches Diner bindet an die Palindromische Erkennungssequenz
-> DNA-Knick auf beiden inneren Basenpaaren
2) Phosphordieselbindung kommt in die nähe des Kat. Zentrum mit Mg2+
-> Spaltung
Sequenzspezifität:
Wenn DNA- Sequenz unspezifisch ist oder Methyliert kommt es nicht zur Spaltung
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